民國87年6月，生態保育聯盟因反對退輔會森保處對棲蘭山林區進行之整理枯立倒木的作法，立即向農委會、林務局提出書面申請，並展開一連串「救林運動」。生態保育聯盟於立法院舉行公聽會，至林務局抗議，民國87年12月集結各方力量成立「全國搶救棲蘭檜木林聯盟」，積極動員社會大眾，並於12月底舉行遊行、為森林祈福活動等。民國88年4月行政院長承諾不再核准枯立倒木作業，立法院亦刪除相關預算，救林聯盟轉而開始推動成立「棲蘭檜木國家公園」。

        地方人士組成「催生國家公園聯盟」，多次拜訪營建署、內政部等部會首長尋求支持，營建署亦開始著手研議成立的準備的工作，民國89年行政院召開研商其成立的可行性，同年9月行政院函請營建署盡速辦理。營建署以任務編組成立推動小組，預定民國90年1月公告範圍同時成立籌備處，5月報行政院核定公告後成立管理處。

        民國89年10月，「棲蘭檜木國家公園」推動小組決議正名為「馬告檜木國家公園」，內政部應擬訂具體國家公園與原住民共管政策，爾後陸續舉行公聽會，民國91年7月行政院原則同意，內政部公告馬告國家公園範圍。後歷經國家公園法全面推動修法，以確保原住民相關權益等內容，因修法案目前進行中，推動成立「馬告檜木國家公園計畫」仍在努力之中。